金門航空站 三樓平面位置圖
文字說明：
三樓航廈左側為貨運站。
入境大廳位於航廈東側，外候機室、接機等候區位於航廈中間區域。
三樓航廈旅客服務項目有：7-11便利商店、餐廳、特產店、租車櫃檯、旅遊櫃檯、服務櫃檯、航空公司櫃檯（華信、立榮）保險業櫃檯、護理站(含AED裝置)、郵局、ATM、行李置物櫃、手機充電服務、茶水間、公共藝廊、免費觀景區、公用電話、打包機服務、無障礙電梯及洗手間（包含哺集乳室、親子廁所及無障礙廁所）。
中間區域有：航廈辦公室、航警辦公室、海關行李查驗、中央監控室、機房、金防部櫃檯、檢疫所櫃檯、航空公司辦公室。