金門地區於民國38年國軍駐防後，曾於西洪五里埔興建機場一座（即西村旁邊），40年6月國防部核准復興航空公司班機飛航金門，每週1班，至民國47年8月23日因砲戰而停航。隨即機場以軍事作戰考量遷移尚義，改由空軍班機飛航至民國76年因往返台金旅客日益增，政府為因應民意需求，乃由國防部及戰地政務委員會協調交通部、民航局等相關單位，奉行政院核定借用尚義機場軍方停機坪及候機室，並於當年9月份由遠東航空公司首航金門－台北航線，為台金民航空運開啟新的紀元。並陸續有復興、立榮、國華、大華、長榮、瑞聯等航空公司先後加入營運。

　　開放民航之後，因往返台金旅客劇增，為因應民眾需求，配合政府推動金門地區綜合建設計劃，由民航局斥資新臺幣11億5,000餘萬元，在尚義機場東北側，另行闢建民航專用站區，於83年3月1日奉行政院核定行正式成立金門航空站，專責場站營運管理，提供旅客安全、便捷、舒適之空運服務、以帶動地區繁榮與進步，同時亦為金門地區交通運輸創下新里程碑。

　　金門航空站自成立以來，迄今即將邁入第16年頭，平均每年服務台金往返旅客約120萬人次，除提供旅客安全完善的服務外，對金門地區觀光事業發展及交通運輸貢獻良多，深受金門地區及台金旅客好評。民航局為配合國軍精實專案，自民國89年1月3日起正式接管金門尚義機場，之後民航局即積極持續改善尚義機場場站設施、提昇飛航安全及服務品質。

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